MANIOC : Impact de la colonisation microbienne des particules sur le cycle de l'azote dans l'océan
Poste de post-doc de 18 mois - Financé par l'Institut Sciences de l'Océan
Description du projet
La fixation biologique de l'azote (N2) est un processus fondamental qui soutient la productivité primaire, le moteur microbien qui capte le CO2 et atténue le changement climatique. Grâce à cette réaction, le N2 est converti en ammonium biologiquement disponible. Ce processus est mené par un groupe de micro-organismes connus comme diazotrophes, principalement attribués aux cyanobactéries, telles que Trichodesmium ou UCYN-A.
Cependant, des études récentes ont mis en évidence l’ample distribution et la contribution potentielle au bilan d’azote de l'océan de diazotrophes non cyanobactériens (NCD), y compris des bactéries et des archées, dont la taxonomie, la morphologie ou l'activité métabolique restent à explorer. Contrairement aux cyanobactéries diazotrophes, les NCD ne peuvent pas faire de photosynthèse, ce qui les rend dépendants d'autres sources de matière organique pour satisfaire leurs besoins nutritionnels. Il semblerait que les NCD soient associés à des particules organiques qui coulent de la surface des océans vers le profond. Ces agrégats sont peuplés de microbes qui jouent un rôle crucial dans le coulage et la séquestration de la matière organique dans les eaux profondes de l’océan.
Ce processus contrôle le cycle et l'exportation du carbone océanique, mais la mesure dans laquelle les processus microbiens influencent la dégradation et l'exportation des particules reste non résolue. La colonisation microbienne des particules ayant un effet direct sur le bilan global du carbone, l'activité et le mode de vie des NCD permettraient ainsi de relier les cycles du carbone et de l'azote dans l'océan.
Le projet MANIOC appliquera une approche interdisciplinaire combinant l'océanographie microbienne, la nanotechnologie, la génomique, la spectrométrie de masse et la modélisation pour révéler comment la phylogénie et le métabolisme des NCD sont liés à la structure des particules dans l'océan. Ensemble, ces résultats fourniront de nouvelles informations sur l'identité, le mode de vie et la structure de colonisation des NCD associés à des particules inexplorées, améliorant ainsi notre compréhension de leur contribution aux flux d'azote et de carbone de la surface aux océans profonds, ce qui est essentiel pour modéliser avec précision leur rôle dans les cycles biogéochimiques globaux.
Profil attendu du candidat
Nous recherchons un candidat titulaire d'un doctorat en océanographie, limnologie ou écologie microbienne avec de solides compétences en méthodes de biologie moléculaire (séquençage d'amplicons, métagénomique, CARD-FISH) et en bioinformatique.
Le projet comprend des travaux de laboratoire avec des cultures et une croisière d'un mois dans l'Atlantique Nord à bord du R/V Pourquoi Pas dans le cadre du projet APERO "Assessing marine biogenic matter Production, Export and Remineralization : from the surface to the dark Ocean" dirigé par C. Tamburini, J. Memery et L. Guidi et du projet ARMORIC "Assessing the Role of cheMolithoautotrOphy on caRbon fluxes in the mesopelagIC realm" dirigé par F. Le Moigne.
Des visites à l'Université de Stockholm sont prévues pour des analyses bioinformatiques en collaboration avec le Dr S. García, responsable du Miint Lab.
Comment postuler ?
Le poste est disponible pour une durée de 18 mois idéalement à partir du troisième trimestre 2022.
Les salaires sont établis par Aix-Marseille Université.
Les candidats peuvent envoyer leur candidature jusqu'au 15 mai 2022 (lettre de motivation, CV et 2 lettres de référence) à Mar Benavides.
Kalliope Pediaditi - Chargée de projets de l'Institut des Sciences de l'Océan AMU - (OCEAN)
Richard Sempéré - Directeur de l'Institut des Sciences de l'Océan AMU (OCEAN)